尼古拉二世夫妇都是英国皇室的亲戚，沙皇尼古拉二世的母亲与当时英国国王乔治五世的母亲是亲姐妹，都是丹麦公主。皇后亚历山德拉的母亲是英国维多利亚女王的女儿、乔治五世的姑妈。乔治五世最初表示愿接自己的表兄妹去流亡，但后来却反悔了（由此造成俄国皇室和贵族的孑遗长期憎恨英国）。克仑斯基只好把尼古拉二世一家转移到革命不激烈的地方：西伯利亚的托波斯克。

十月革命推翻临时政府后，尼古拉二世一家被苏维埃政府转移到叶卡特琳堡，1918年七月17日晚被乌拉尔苏维埃政府以尤乌洛夫斯基为首的行刑队枪决。7月20日莫斯科和彼得堡公开报道人民公敌沙皇被枪决，7月22日叶卡特琳堡地方报纸报道沙皇被枪决而家庭成员被转移。七月20日至九月下旬，布尔什维克外交委员会主席和欧洲司领导人多次表示，沙皇后亚力山德诺娃及其子女是安全的，可能以人道的理由释放，也提出可能以他们交换在德国的俄国战俘。

尼古拉二世被枪决后的第八天，白军攻占叶卡特琳堡，并派索霍洛夫调查尼古拉二世一家的命运。他访问了一些当地人，在一个废矿井里找到一些遗物，包括沙皇家庭医生的假牙和狗的残留物等。1919年夏天，红军把白军赶走后，他的调查也就中止了。

1924年索霍洛夫在巴黎出书，称行刑队枪决了尼古拉二世，皇后、22岁的奥尔加公主、21岁的塔吉扬娜公主、19岁的玛丽亚公主、17岁的安娜丝塔西娅公主、13岁的阿列克谢王子，还有医生、司机、厨师和皇后的女官以及宠物小狗。一个疑问：为什么没有任何尸体残留物？索霍洛夫在书中的解释是，行刑队枪决后把人丢到废矿井用硫酸处理后又用汽油烧毁了。索霍洛夫的调查结论较快为西方接受，不过沙皇的母亲却一直不相信儿子一家死了，也拒绝见索霍洛夫或他带来的“遗物”。

《沙皇最后的日子》内容有很多看似抄袭索霍洛夫的书，其中有一点却值得注意：尸体在废矿井处理和烧毁后，又转移到另一沼泽地掩埋了。苏维埃政府从此不再否认尼古拉二世全家及随行人员的死亡，当地还有好汉出来讲，谁是枪决谁的英雄。1927年尤乌洛夫斯基的左轮手枪交到红场的革命博物馆，成为革命历史文物。

关于尼古拉二世全家的命运，此后常有谣传说安娜丝塔西娅公主和阿列克谢王子没有死，时不时还有各种各样的人冒充他们。1976年英国广播公司两位记者发表著作，其中引述了专家对找不到尸体的疑问，这些法医或体质人类学家认为，即使经过硫酸和汽油的处理，像牙齿一类也还会留下残留物。

1977年时任克格勃首脑的安德罗波夫建议总书记勃列日涅夫，拆毁处死沙皇的房子。西伯利亚斯维尔得诺夫思克地区的第一书记直接贯彻了指示，推土机有效地完成了这一任务。关于尼古拉二世一家的命运，好像也就没有更多的东西可以知道了。

但是在斯维尔得诺夫思克当地，有一位地质学家阿乌栋宁长期对尼古拉二世一家的命运感兴趣。他成功地使一位莫斯科来访者也大感兴趣。这位革命家庭出身的莫斯科人雷波夫是一位电影制片人兼侦探小说作家。回到莫斯科后，他以拍片需要为借口，通过内务部长要求查阅有关沙皇的材料。一方面阿乌栋宁根据索霍洛夫和拜科夫书中不受重视的线索，在当地寻找尸体的埋葬处；另一方面，雷波夫在1978年找到了当年行刑队头目尤乌洛夫斯基的长子亚力山大。这位退休海军将军长期秘密收藏着一份其父在1920年写的关于行刑报告的副本。他把这一被禁止公开的报告交给了雷波夫。

报告中有行刑经过，如十一个死者聚集在半地下室以为要被拍照，岂料被十一个行刑者同时开枪射杀（有两位行刑者因原定的行刑者不肯对妇女儿童开枪而临时换上的）。报告写道，在废矿井里处理尸体后，因担心当地人走漏风声，尸体又被转移，路上有一男一女两具尸体给埋了，其他尸体埋葬地点的确切方位都记下了，这个方位正好位于阿乌栋宁所探察的区域。

1979年阿乌栋宁和雷波夫等人在那里挖到了尸骨，带了两个头骨回家，可是却不知如何是好，1980年便又把头骨埋了回去。1989年雷波夫觉得到了可以公布的时候了，他先向戈尔巴乔夫去信，没有获得理睬，随后他便向报界公布了情况。

1991年叶利钦当选为俄国总统。同年阿乌栋宁在当地政府支持下一起去挖尸体，最后总共挖到了九百多块尸骨，法医可以凑成五女三男，与尤乌洛夫斯基报告中此地应该少一男一女吻合。俄国卫生部派来的法医从头骨分析，少了玛丽亚公主和阿列克谢王子；美国佛罗里达大学的法医从骨头分析，少了安娜丝塔西娅公主和阿列克谢王子。

这些依赖骨头牙齿等做解剖特点分析的结论有一个重要前提：就是这些尸体材料要确实来源于所猜想的那一组人。这个前提是否对，是由分子生物学手段来检验的。分子生物学在俄国并不是世界上最发达的。苏维埃政府早年，大批摩尔根的基因说为资产阶级学说，现代遗传学、分子生物学在俄国起步不快，DNA指模诊断还得到外国去做。

任务落到了俄罗斯科学院分子生物学研究所的伊凡诺夫的头上。他把每人的骨头带了一点到英国，经分析容易确定皇后亚力山德拉的身份。三个女儿的关系也好定了。尼古拉二世身份的确定多花了点时间，最后把他早已入土的弟弟开棺取材，在美军病理研究所比较而肯定证明。这些分析结果于1994年和1996年发表在著名的学术杂志《自然遗传》上了。

至此除了一位公主（安娜丝塔西娅或玛丽亚）和皇子阿列克谢的尸体没有找到外，尼古拉二世一家的命运总算是清楚了。而且，在英国皇室沉默的内疚和尴尬中，尼古拉二世一家在伊凡诺夫的皮包里，也算是终于登上英国国土了。1997年美国推出动画片《安娜丝塔西娅》，好像有会成为《白雪公主》、《睡美人》一类流行故事的可能，里面把坏事都归咎于拉斯普丁(那位为皇后所宠的“农民圣人”)，并让安娜丝塔西娅公主还活着。童话总是比现实简单和理想。